Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRMUO75648 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRMUO75648 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRMUO75648 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms