Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NIPSNAP2O75323 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms