Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA3O43365 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HOXA3O43365 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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