Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC7A4O43246 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms