Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
USP9YO00507 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms