Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARID3CA6NKF2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARID3CA6NKF2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms