Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HIF3AQ9Y2N7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HIF3AQ9Y2N7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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