Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGSF9BQ9UPX0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms