Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PHF8Q9UPP1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms