Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM8A1Q9UBU6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms