Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TFIP11Q9UBB9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms