Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL28Q9NXS3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms