Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPRHQ9HD43 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRHQ9HD43 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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