Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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TMEM38AQ9H6F2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMEM38AQ9H6F2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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