Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
VN1R3Q9BXE9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VN1R3Q9BXE9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms