Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms