Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRMT61BQ9BVS5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms