Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ATG101Q9BSB4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms