Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KCNS3Q9BQ31 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms