Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMAD5Q99717 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMAD5Q99717 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms