Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PITX2Q99697 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PITX2Q99697 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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