Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLPTM1LQ96KA5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms