Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRIQ1Q96JM4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms