Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHAMP1Q96JM3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms