Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BORCS6Q96GS4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms