Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKD1Q969G9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms