Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOBEC4Q8WW27 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms