Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf43Q8TAL5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms