Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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TMIEQ8NEW7 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMIEQ8NEW7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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