Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC112Q8NEF3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms