Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDKL3Q8IVW4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDKL3Q8IVW4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms