Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STRCQ7RTU9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STRCQ7RTU9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms