Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KNDC1Q76NI1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KNDC1Q76NI1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms