Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms