Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC174Q6PII3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms