Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
WASHC2DQ5SRD0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms