Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A52Q3SY17 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A52Q3SY17 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms