Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF8Q3BBV2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms