Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KNOP1Q1ED39 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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