Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LAMA3Q16787 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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