Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN9AQ15858 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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SCN9AQ15858 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCN9AQ15858 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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