Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
RYR3Q15413 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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