Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK13Q14004 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK13Q14004 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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