Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1SQ13698 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CACNA1SQ13698 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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