Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ITGA7Q13683 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms