Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKD2Q13563 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms