Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SRSF6Q13247 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SRSF6Q13247 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SRSF6Q13247 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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