Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RPA4Q13156 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPA4Q13156 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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