Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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