Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ACACAQ13085 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACACAQ13085 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms